釋迦牟尼佛住世時，有菩薩名除蓋障—八大菩薩之一，懇求釋尊傳授六字大明咒，釋尊雲：“我於過去世，曾經向蓮花象王佛學習此咒。”而蓮花象王佛又從何處學習此咒耶？
原來蓮花象王佛經歷無數世界，學習此咒不得結果，及至西方極世界，謁見阿彌陀佛，阿彌陀佛乃請觀世音菩薩傳授，當時大地震動，天雨寶華，種種神變瑞相現前。蓮花象王佛獲咒後，普度眾生，無量無數。
釋尊在過去世，未成佛前，曾得蓮花象王佛傳授此咒，而成佛後，亦曾傳授此咒多次。惟當除蓋障菩薩請求傳授，釋尊卻雲：“印度某大城中，觀音菩薩化身為一居士，彼起止污穢，且有妻有兒，但不可輕視，彼實為觀音菩薩化身也”。
除蓋障菩薩於是率領千二百名羅漢，旨謁居士。居士傳授六字大明咒之後，即示現種種神通變化，除蓋障菩薩以瓔珞供養居士，居士卻之雲：“我不須要供養，你供養釋迦牟尼佛可也”。
度生事業遍滿空界
六字大明咒理廣博，略釋如後：
咒雲：
嗡嘛呢叭彌吽
（一）
叭彌： 蓮花開敷
（二）
嗡： 白光
吽： 雷聲施無畏
（三）
嗡： 皈命
叭彌： 蓮花開敷
吽： 三身、三學。
（四）
嗡： 法報化三身
吽： 雷吼施無畏
（五）
嗡： 生起
嘛： 智寂；謂以智冥理（智理一如）
呢： 寂滅無生
彌： 出生
吽： 擁護
（六）
嗡： 離障
嘛呢： 離垢；是如意寶珠，光凈無染，能增長功德，無不如願成就。
叭： 滿願具足，是全開蓮花；觀音菩薩感應道交如蓮花開敷，圓滿具足。
彌： 除災降伏
又：嗡： 佛部
嘛呢： 寶部
叭彌： 蓮花部
吽： 金剛部
（七）
嗡： 心光圓滿
吽： 施願吼、三施無畏
（八）
叭彌： 一塵不染
（九）
嗡： 慧光普照
嘛呢： 無著無礙
叭彌： 心空萬法空
（十）
叭彌： 心凈則佛土凈
吽： 福緣善慶
（十一）
嗡： 普安文佛
呢： 定光王菩薩
彌： 無量壽菩薩
吽： 大力尊菩薩
（十二）
嘛： 表阿修羅道脫離鬥爭之慘
呢： 表人道脫離貪嗔痴慢妒五毒
吽： 表地獄道脫離血冰刀火之災
摧碎七情六慾，得斷六道輪迴，故雲六字大明咒之功德寶無量無邊也。
（十三）
嗡： 能閉塞流轉天道之途；念持此字，臨命終時，中陰身不得生天道。
嘛： 能閉塞修羅道，使靈魂不得入；觀音菩薩將六道閉塞，只余菩提道。
呢： 能閉塞人道，使離再生人道苦；即將十道中九道（天、人、修羅、地獄、餓鬼、畜生、聲聞、緣覺、菩薩）悉皆閉塞，而余佛道。
彌： 能脫離沉淪餓鬼道之慘痛。
（十四）
嗡： 表天道之白色
嘛： 表修羅道之青色
呢： 表人道之黃色
叭： 表畜生道之綠色
彌： 表餓鬼道之紅色
吽： 表地獄道之黑色
（十五）
表法有二：1.以六凡；2.四聖
1、 以六輪迴： 六凡而言：
嗡： 表天道
嘛： 表修羅道
呢： 表人道
叭： 表畜生道
彌： 表餓鬼道
吽： 表地獄道
2、 以地位而言：
嘛： 入十住位
呢： 入十行位
叭： 入十迴向位
彌： 入十地位
吽： 入金剛乘大覺位
是以念持六字大明咒，能超越十地，成就無上正等正覺，此四聖之表法也。
嗡： 成白色
嘛： 成紅色
呢： 成黃色
叭： 成綠色
彌： 成藍色
吽： 成黑色
功德與世俗之福德相異，福德乃有漏，有限制者；功德則無漏，無限制也。以六祖壇經而言：平等是功，現性是德。
功德偈：
功超有漏證無漏
此謂每日均須改造人心，若不改造，則無功德，始終輪迴也，發願小者將人心改造為羅漢心，亦有改造為緣覺心，或菩薩心者，而無上正等覺三字遂改為無上菩提心。
四聖甚好，仍以佛為究竟。
念持六字大明咒，能促使恢復自性蓮花，如蓮花處水不染，此喻六根六塵不染著義： 如意寶珠即出現，乃能破我執，一切如意具足；然若為六根六塵八識蓋覆，即成障礙也。
