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先要請師灌頂傳法後才可以修。得法後先將咒念熟，然後上座修持。
一、入座，合掌，念四皈依咒語 3─7 遍： 二、念三遍：“南無根本上師母音阿闍黎，南無十方三世諸佛、菩薩、金剛、護法神祇。”
三、念一遍：“祈求根本上師母音阿闍黎，祈求十方三世諸佛、菩薩、金剛、護法神祇慈力加被，消我業障，使我 安心入佛，虔修妙法，早日成就，救度眾生。”
四、結大蓮花手印（黃布蓋手）：uploads/content/2022/may/2961a22c2f279b2bf022947139379dea.jpg" />
掌根、拇指、小指，三點合，其餘六指自然分開，置於胸前。即：合掌後，自然分開六指。
“嗡（ong）嘛（ma）呢（ni）叭（bei）咪（mei）吽（hong）”（每分鐘大約40遍）。
五、修完後，準備下座：手印舉頂，念六字大明咒15遍。再念一遍發願文： 六、頂上散印，下座 。功德無量也！！
修六字大明咒的注意事項 上座前：（1）凈手；（2）設備一切；（3）禮佛，不必焚香，尤忌好香多煙，坐在床上修為宜，如出門或不便，即行心拜點心香也可。
上座有八忌：（1）忌風處坐；（2）忌飽後坐，飯後一個半小時為宜；（3）忌下座即解大小便，必須過十分鐘後才可以解；（4）忌貪坐，一時高興多坐，以後易退轉，以每天一座，最多二座，每座一至二小時為宜；（5）忌大聲持誦，免傷氣，要金剛持（唇動無聲，自己聽見）；（6）忌身體多動，必致腰疼，伸腰要慢，身體不必過於正直；（7）忌求見光見佛；（8）忌有幻象時執取生疑，如聞妙香妙音，生歡喜心等皆可致病。
此法有手印直證無相門，以心靈為主，不必觀光觀字，與藏密修法不同。
修法三要：一要在上座時手印不能散開，此是身密，以此戒殺、盜、淫身三惡業；
三要心空如佛，自己即是四臂觀音，觀一切眾生如醉、病之佛，一醒即愈，同體不二，此是意密，以此戒貪嗔痴的意三惡業。
修此法，於平時用功最為切要，時時注意：（1）不許犯殺、盜、淫妄諸罪業，改除習氣，否則縱學法也無益。
（2）不許起貪嗔痴諸邪見，時時求開智慧，處處觀空、學習布施。
（3）不許輕慢他法及未修之人，應當平等慈視，不可求神通及名聞利養。
（4）常念孝敬觀世音菩薩及歷代傳法大師的慈悲，並尊重自己的佛性，知人人本可成佛，當發救度眾生之願，此便是最大供養。
（5）當盡孝悌忠義諸人倫道德，圓滿世法，克盡人事，方可成佛。
（6）修法者應供四臂觀音像一尊，若無有觀音，其他妙相也可以，如實無力，不供也可，因為有眾生處即有佛。
（7）修時手印要用黃布或其他凈布蓋上，勿與未修人、兒童結印嬉戲，念咒以音準為要。
修時雜念紛起，可能會覺得比平時還多些，此是好的，是進步的表現，不是壞，切勿疑而中止。只要不理，一心顧到咒，自然會心思安謐而心定。不可硬求無念，尤其是初學時，無念便是壓迫，久之如同木石，也是一病。應當有念，只是不著不緣，如暢通大道，一切車馬行人不是不來往，不是不見不聞，而是不留不住，這才叫作無念。
本修法去病種種此法本不為治病開設，但心定則氣和血旺，百病自可消解。此六字“嗡”字去除一切病，“嘛”字除熱病，“呢”字除氣病，“叭”字除痰病，“咪”除寒病，“吽”除膽病，從這個角度講，病者修此也相宜，凡失眠、高血壓、腦病、肝胃、心血管、怔忡、麻木以及婦科等諸症都有較顯著效果，宜注意以下各方面：
（1）不問何病，總以保養心臟為主，其法可分開源節流二種，不動肝火，安心寧神，氣和血旺，是謂開源；思慮少，惱怒不生，則氣血不耗，是謂節流。能開源節流，自然長壽，每日修此法，必可息心平氣增長血球，但在坐時如身體感覺不適或老病復發，這是在拔除夙病伏根，有好處，這與發病不同。時間稍長自然會愈。切勿生疑而中止，應當發大願，念曰：“我修此法為解一切夙業，舊病雖來我生歡喜，從此拔根，願天下一切同病，我皆代受其苦，我如修法有成必普度一切眾生，使皆明心成佛，永斷諸病苦。”每日上座前發此大願，切勿忘記。此法以一百天為期，必得奇效，修滿千日，必證得三昧定。
（2）上座後要忘記自己是病人，不要想著自己的患病處，否則會氣血凝聚，病難除去。
（3）下座後以少氣惱為主，忌食蔥蒜，忌聞好香，因為此物易於動肝；魚、肉也宜少食，此物易於動欲，心多思欲與法不相應；平時遇事以忍為貴，想到皆為自己夙業冤報，應當承受，通過修法予以解除，逢凶化吉。
（4）修此法不必擇時擇地擇向，只要一心恭敬即可。婦女可日日修，不要間斷。老人修此法更妙，患老年腰腿疼如法修持必可復原，並且無中風怔忡等病，首靠自己虔修之力，再靠菩薩加持之恩，血氣自然易於打通。
如法修滿一百日後，如家中有病人，可結印念咒一百零八遍或千遍，加入凈開水中使病人服下，皆能見效，若病人能自念予以配合，效果更好。
