2 如來藏與阿賴耶
《入楞伽經》說「如來藏藏識」，即是說人的心性，是為受煩惱纏所覆障的如來藏。如來藏既受覆障，即顯現為藏識(阿賴耶識)。此中的過程，寧瑪派有不共的說法。
摧魔洲尊者(bdud 'joms gling pa，1835-1904)在《凈治明相》(snang sbyang)中說——
由無明而令本始基受障者，殆為阿賴耶無疑。阿賴耶如瓶中之頑空，無思亦無明相顯現，有如昏睡或失知覺境界。完全沈滯於此境界者，即「痴」之自性，亦即無明之廣大流轉顯現。[注6]
所謂本始基(gdod ma'i gzhi)，亦稱為「基界」或「所依界」(gzhi dbyings)。輪迴界與涅槃界的一切顯現，寧瑪派都稱之為「明相」，本始基便即是一切明相自顯現之所依。
有些經論，將本始基稱為「本際」。如《勝鬘經》說——
亦有將本始基說為「一界」。如《不增不減經》說——
一切愚痴凡夫，不如實知彼一界故，不如實見彼一界故，謂眾生界增、謂眾生界減。[注8]
這「一界」，既為眾生界所依，亦為法身之所依，即是本始基的定義。是故經言——
不離眾生界有法身，不離法身有眾生界；眾生界即法身，法身即眾生界。舍利弗，此二法者，義一名異。[注9]
總而言之，無論本始基、本際、一界，其實都是方便施設，成立一個輪迴涅槃一切明相自顯現所依的基礎。這基礎法爾，周遍一切界，亦無自性，但它卻不是如來藏，因為它施設為基界而不是施設為智境。
頑空的阿賴耶(alaya)不是阿賴耶識(alayavijnana)，因為它未起分別(還未成為分別所依的基礎)，無分別功能即不能稱之為識。但它卻是煩惱纏，因為無明即是煩惱。
《凈治明相》接著說——
由此境界，業力風息晃動，此即嫉妒之體性，其功用為令一明分於空性中生起，此即阿賴耶識，住於嗔之體中。
複次，亦由此而有污染意，即因有自身之顯現而執「我」見，此則住於慢之體性。
由此復有意生起，此即於本始基空性中生起明相之基礎。明分由此而生，此則住於貪之體性。[注10]
貪嗔痴妒慢五毒(煩惱)至此已完全呈現，煩惱纏由是即告完成。所以阿賴耶並非煩惱纏的整體，而是煩惱纏的根本。《勝鬘經》說，如來「菩提智」所應斷除的諸法，「一切皆是無明住地所持所建立」，這阿賴耶便即是無明住地，是故為根本。
是故如來藏是依、是持、是建立，不離不斷不脫不異不思議佛法。[注11]
因此，阿賴耶與如來藏不是相依，因為二者不同時、可異離，否則一切行人都無法解脫。它們最低限度亦是相對(暫且不說其為相礙)，阿賴耶可說為染，如來藏則可說為凈，由是而成相對。
由二者相對，即可建立眾生界有三種法，由如來藏與阿賴耶相對而成立，此如《不增不減經》雲——
經中復言，第一種法是無始以來的清凈相應法體，「我依此清凈真如法界，為眾生故，說為不可思議法自性清凈心。」這即是說，眾生的自性清凈心與真如法界相應，因此眾生才有成佛的可能，這就即是佛性，即是空如來藏，亦即 涅槃界的體性。
經中說第二種法，是唯有如來菩提智才能斷滅的、與如來藏不相應的不清凈法，「我依此煩惱所纏、不相應不思議法界，為眾生故，說為客塵煩惱所染［之］自性清凈心不可思議法」。這就即是憑藉由阿賴耶成立的識境而作顯現的如來藏，這就即是眾生的心識，亦即是輪迴界的顯現。
經中說第三種法，為一切法的根本，「備一切法，具一切法，於世法中不離不脫真實一切法，住持一切法，攝一切法」。這便即是諸佛示現的功德，大悲周遍，是故成就一切法，亦即周遍一切界皆是生機，因此說，「我依此不生不滅、常恆清涼不變歸依，不可思議清凈法界，說名眾生。」這亦即是說，雖然由大悲成立一切界的生機，由是有種種眾生(不同時空、不同形態的眾生)，眾生雖有煩惱，但卻其實依然歸依於此不生不滅、常恆、清涼、不變的清凈境界。這就即是不空如來藏，由於為世法之所歸依，是故不空。
不空如來藏［智］，過於恆沙，不離、不脫、不異不思議佛法。[注13]
這兩種如來藏空智，分別與上說第一種法、第三種法相應。至於第二種法，則與如來藏本際不相應，受如來藏智斷除。但如果沒有這第二種法，則亦沒有餘兩種法，因為離輪迴界即無 涅槃界，亦無所謂大悲周遍的功德。
│ 相應體 (空智) │
不相應體 (大悲)
第一種法即是［空］如來藏，亦即空智(空智即是清凈境界)，無上密續部稱之為佛母壇城。
第二種法即是阿賴耶，亦即大悲(顯現為明相是故為大悲)，無上密續部稱之為佛父壇城。
第三種法即是空智與大悲雙運(有時亦說為樂空雙運)，無上密續部稱之為佛子壇城。
那麼，阿賴耶識在這里占甚麼地位呢？它正是「如來藏本際不相應體」，亦即是依於如來藏(以如來藏為本際)但卻與如來藏不相應的境界。它與自性清凈心相對，因為自性清凈心即是「如來藏本際相應體」，亦即是依於如來藏而與如來藏相應的境界。
必須了知上來所說，才能理解《不增不減經》之所言。
在經中，世尊對舍利弗說，增見與減見(謂眾生界增，謂眾生界減)，即是兩種極惡大邪見。舍利弗於是說，「善哉世尊，此義甚深我未能解。」由是佛即告言——
甚深義者即是第一義諦；第一義諦者即是眾生界；眾生界者即是如來藏；如來藏者即是法身。
舍利弗，如我所說法身義者，過於恆沙，不離、不脫、不斷、不異不思議佛法、如來智慧功德。[注14]
在這里所說的「法身義」，便即是不空如來藏智，以及由其生起的功德。
下來，即將由如來藏與阿賴耶說此不增不減。不過在說此之前，卻想先由龍樹的《法界贊》(施護譯名為《贊法界頌》)，一談法界。因為必須了解何謂法界，然後才能正說不增不減。否則便將纏夾到體、用的問題上去，那就必然無法體會不增不減的真實義。
注釋
6 見《寧瑪派次第禪》，頁56。
7 大正·十二，no．353，頁222b。
8 大正·十六，no．668，頁467b。
9 大正·十六，no．668，頁466b。
10 見《寧瑪派次第禪》，頁56。
11 大正·十二，no．353，頁222b。
12 大正·十六，no．668，頁467b。
13 大正·十二，no．353，頁221c。
14 大正·十六，no．668，頁467a。
