菩薩行持六度萬行，六度法門即檀波羅蜜(布施)、屍羅波羅蜜(持戒)、羼提波羅蜜(忍辱)、毗梨耶波羅蜜(精進)、禪那波羅蜜(禪定)、般若波羅蜜。
布施就是施捨，包括財布施、法布施、無畏施，布施度慳貪；持戒是守持戒律，包括比丘戒、菩薩戒等，最基本的是五戒：不殺生、不偷盜、不邪淫、不妄語、不飲酒。通過行為的約束，達到使心清靜的目的，持戒度毀犯；忍辱是忍受他人的惱損，進而如如不動，悟入無生法忍，忍辱度瞋恨；精進是精而不雜、進而不退，指努力修行，精進不懈的度眾生，精進度懈怠；禪定又稱靜慮，指心的安止，包括四禪八定等，禪定度散亂；般若指大智慧，是本經的宗旨所在，般若度愚痴。
般若是修慧，前五度是修福。如果離開了般若波羅蜜而修持其他五波羅蜜，則只是有為之善法，無法證悟法性而得解脫，所以般若才是佛法的根本，才是佛法與外道區別之所在。菩薩修布施等五度時，皆不能離開般若智慧，如《金剛經》所言：「菩薩於法，應無所住，行於布施。」布施要三輪體空，外不見有受施的人，內不見有能施的我，於其中間，亦不見有所施之物。本經特別顯示般若的本體，以及說明般若智慧的妙用，使修學佛法的人，運用般若真空的智慧，來駕駛前五度的船隻，駛向究竟成佛的彼岸。
深般若
實相般若指諸佛證悟的法界真實之相，觀照般若指依法界實相之理體進行觀修，文字般若指借用文字表述實相般若的境界。實相般若為體，文字般若為相，觀照般若為用。所以修行以聞思文字般若為下手處，進而實修觀照般若，最終證悟實相般若而成就。
《金剛經》說：「一切賢聖，皆以無為法而有差別。」聖賢所證悟的般若也有深淺的差別，證二乘果者，只破我執，法執尚存，所證智慧不能稱為深般若；初發心下位菩薩，觀力微薄，未深入諸法實相，也不能叫深般若；大菩薩們已證法空，於一切法自在，所行稱為深般若。
般若波羅蜜多指破盡我法二執、證悟法性的大自在境界，也可稱為證悟無分別智。
證悟無分別智分為三個階段。
第一階段：尋思慧，用尋思分別的意識心參究自性，這個階段叫加行無分別智。
第二階段：內證慧，明心見性時，妙明真心自顯，為根本無分別智。
