一、如何加持母瓶：
首先，準備乾淨的母瓶與子瓶兩種，若有佛堂者將其供在葯師佛像前，能燃燈懸幡更好；並在兩種水瓶上貼上藥師咒輪。母瓶應容量較大可放多一點的水，子瓶不需太大方便攜帶；母子瓶都應保持有水。母瓶的下方放置葯師咒的念佛機，子瓶放置於母瓶旁，並24小時不間斷播放葯師咒，以咒音的不可思議音波不間斷的加持母瓶凈水。若要用葯師咒水利益他人時，可以從母瓶倒母水於子瓶使用，如此可保持母瓶之水有不間斷的葯師咒加持；母瓶每次取出水時必須剩有母水，不可全部取盡，之後再加入新水混入即可。
二、如何使用子瓶：
行者每日念108遍葯師咒前，先以母瓶水倒滿子瓶，再將子瓶放置於佛前念咒加持；念誦後再將加持過的水倒回母瓶中，這樣母瓶也有行者親自念誦的加持力。行者念誦完葯師咒後，再將子瓶放回母瓶旁；子瓶之水也不可倒盡，約留十分之三的水於子瓶。另外在每次若要用葯師咒水利益他人時，從母瓶倒母水加滿子瓶，再由行者念葯師心咒（唵 鞞殺逝鞞殺逝 鞞殺社三沒揭帝 莎訶）108遍（時間允許可念更多遍）加持之後，發利益他人之菩提心，至誠祈求葯師佛慈悲加持此水後，即可將子瓶帶出使用。
另外也可隨力參加葯師法會，會後若有結緣葯師咒水也可以混入母瓶水中。
三、此法的特殊有以下幾點：
（1）全天候不間斷加持：若以20秒念1遍葯師咒的念佛機為例；等於一分鍾念3遍，一小時念180遍，一天就有4320遍的葯師咒加持；若一個月就有129600遍的葯師咒加持，一年1555200遍加持。這是以念佛機咒音聲波加持的部分。（若有速度更快的念佛機就可以更多遍。可以自己找適合的檔案請念佛機廠商製作）
（2）行者親自加持：行者每天必須持108遍（或更多遍）葯師咒加持子瓶，再將子瓶之水倒入母瓶。這樣一個月母瓶水就有3240遍行者親自念誦的效果。
（3）再次加強效果：要使用前將母瓶水倒滿子瓶，再於早晚課時於佛前念108遍葯師咒心（唵 鞞殺逝鞞殺逝 鞞殺社三沒揭帝 莎訶），再特別稟告葯師佛這水是為了何人何事祈求，之後就可以使用咒水，如此便能自利利他。
（4）總匯加持：若參加法會結緣或有任何加持過的葯師咒水也可以加入母瓶中。
◎《葯師琉璃光七佛本願功德經》：『複次曼殊室利。彼葯師琉璃光如來得菩提時。由本願力觀諸有情。遇眾病苦瘦瘧干消黃熱等病。或被厭魅蠱道所中。或復短命或時橫死。欲令是等病苦消除所求願滿。時彼世尊入三摩地。名曰滅除一切眾生苦惱。既入定已。於肉髻中出大光明。光中演說大陀羅尼咒曰：
南謨薄伽伐帝 鞞殺社窶嚕 薜琉璃缽喇婆 曷啰闍也 呾他揭多也 阿啰喝帝 三藐三勃陀也呾侄他唵 鞞殺逝鞞殺逝 鞞殺社三沒揭帝 莎訶
爾時光中說此咒已。大地震動放大光明。一切眾生病苦皆除受安隱樂。
曼殊室利。若見男子女人有病苦者。應當一心為彼病人清凈澡漱或食或葯或無蟲水咒一百八遍與彼服食。所有病苦悉皆消滅。若有所求指心念誦。皆得如意無病延年。命終之後生彼世界。得不退轉。乃至菩提。是故曼殊室利若有男子女人。於彼葯師琉璃光如來。至心殷重恭敬供養者。常持此咒勿令廢忘』
◎《葯師如來念誦儀軌》：『若有受持此真言。能拔身中過去生死一切重罪。不復經歷三途。免離九橫超越眾苦。十方世界隨處安樂。自在無礙法應如是。』
◎如果每日持誦葯師咒，一切諸佛菩薩與總攝一切諸佛大威勢力的金剛手菩薩、四大天王和其他護法將會一直保護並引導我們。我們的一切惡業都會凈除，迅速地息除疾病及魑魅傷害。
◎因為眾生的心更墮落，一切也都更加墮落。食物和藥物的力量減退，甚至咒語的力量也削弱了。所以現在修本尊法，都必須比以前持更多的咒。
不過，基於葯師諸佛往昔許諾的力量，實際上藥師咒在濁世反而更有威力。這是很有必要持誦葯師咒的理由之一。
◎葯師諸佛往昔曾經許諾，濁世眾生所發的願，必定要成功。每一尊葯師佛都發過許多願，要紓解眾生的種種困境。
◎眾生甚至只要聽到葯師佛的聖號或咒語，便不會墮惡趣。葯師佛法門具有強大的威力，帶來現前及究竟的成功。
◎葯師咒具有強大的威力，不僅限於療愈疾病，也能夠凈化生者和亡者的業障。如果能夠本著菩提心，在臨終者或動物耳邊，持誦葯師佛的聖號和咒語，最好不過了，因為那將使他們不墮惡趣。
◎如果亡者已經聽不見了，可以持葯師佛咒，然後直接在他們身上吹氣或者先在滑石粉、香水上吹氣，然後把粉末、香水塗抹在他們身上。
◎持葯師佛的咒語，然後在所吃的肉上面，或死屍、死者的骨頭上面吹氣，都很有利益，可以凈除亡者的業障，使他們得以往生凈土或上界。
◎如果你是肉食者，應當利益你所吃的被宰殺的動物。在吃肉之前，應當持誦這個強力的凈障咒，而且猛力地迴向，使那些動物即刻脫離惡趣，往生凈土或上界，永不再墮惡趣。
◎即使動物或人已經死了幾百年甚至上千年之久，心識還在惡趣，如果持誦葯師佛咒之後，在他們的骨頭上吹氣，照樣可以把心識遷移到凈土或上界。
◎持誦葯師佛咒語之後，也可以吹氣在水上、沙上或滑石粉上，再灑在死亡的動物或人的骨頭或皮膚上。這么做至少可以縮短亡者在惡趣受苦的時間。
◎修葯師法不但對重病的人很有效，還會帶來事業、修行或者其他事行的成功。
奉請：
