煩惱，每個人都有。很多時候，我們認為煩惱和痛苦是一體的。佛教里將煩惱視為一種負面的思想或情緒。有了煩惱，便會產生痛苦。
偉大的釋迦牟尼佛告訴我們：脫離輪回最大的障礙就是煩惱，而菩薩在成佛之前的障礙稱為所知障，煩惱和所知二種障礙的本質就是光明的如來藏。原始清凈的如來藏，經由我們的主意識，通過眼耳鼻舌身等五根，對外在的色聲香味觸產生五識。在意識、五根、外境的交互循環過程中，讓心有了混濁的狀態，這種情形在佛經里有何種譬喻呢?就像海水本身是清澈的，不會有浪，但為什麼海面會生起如此大的混濁波浪?是風讓海水起了波浪。所以，這種突然生起分別的識，既捉不住它，也不清楚它是正面或負面，這種混沌不解的疑惑就是無明，也是所謂的客塵污染。而心的原始本質就像是海底的水，永遠都是清凈的，具備著高度的智慧以及圓滿的慈悲，這稱為佛性。
煩惱，是因為有無明有分別心而產生。煩惱是思想的一種狀態，不是指因煩惱而起的種種痛苦。痛苦是煩惱的果，解脫輪回的障礙就是煩惱造成的。所以，要脫離輪回之苦，必須先了解煩惱如何產生?該如何滅除?這樣才知道如何對治它。寧瑪巴的大師米滂仁波切說：「什麼是煩惱?貪欲等稱為煩惱。」歸納來說，煩惱就是貪念、嗔恨、嫉妒、傲慢、疑心等，稱為五毒。
從無始輪回以來到現在，我們已經非常習慣負面的思想和行為，對於正面的思想或行為卻需要努力學習才能展現。我們與生俱來、不需經過學習便存在的，就是煩惱。所以，母親懷胎時，胎兒可能因為不高興，在母親的肚子里拳打腳踢，歡喜的時候也會露出笑容。胎兒在母親體內的喜怒哀樂，都來自於前世延續的習氣。而出生後，嬰兒對喜歡的事物會感到很開心，對不喜歡的事物也會用哭鬧的方式來表達，這些都是與生俱來的習氣。更嚴重的是，隨著年齡的增長，慾望及嗔恨心也跟著增長。從懂事以來，我們就有貪念，因為要滿足當下飢餓的需求，對正面的親切關懷會歡喜接受，對負面的語言會有抗拒之心，這些都會隨著年齡不斷增長。
我們小時候的貪念、嗔恨、傲慢，是前世所播下的種子在今世成熟了。但是，在年紀還小、對很多東西還不懂分別的時候，這種毒還只是種子，看不出來後果有多嚴重。就像是食用被污染的水或食物而中毒一樣，剛開始根本感覺不到毒性的存在，等到日積月累，傷害就愈來愈重。多數的毒物在剛開始享用的時候，感覺是舒服的，有快感的;而隨著中毒愈來愈深，痛苦會愈來愈烈。除非出生在有良好道德觀念或有正確宗教信仰的家族，才不會持續惡化，這也是自己和家族在前世福報的共業成熟，才有機會讓自己在今生的教育下慢慢改變看待事物的觀點。
就像一個小朋友，當別人欺負他的時候，他會哭著跟家人投訴。如果是不理智的父母，沒有正確道德觀念，大多會告訴小朋友用以牙還牙的方式反擊，而不會告訴他正確解決問題的方法。之後，小朋友心裡就會慢慢建立起負面模式的思考了。這種情形容易發生在父母有暴力傾向或口無遮攔的家庭里。有些小孩在剛學會走路的年齡，就會用暴力解決事情。或是業力更深的，當他發脾氣，可又無法對別人使用暴力時，會反過來咬自己發泄。這時如果父母有慈悲的心，好好教導小孩，正確理解這些嗔恨是不好的，再慢慢引導他往正面發展，小孩的嗔怒習氣是可以改變的，因為前世帶來的是還沒成熟的種子。如果知道土裡種的是罌粟花等具毒性植物的種子，只要不在上面灑水、施肥，沒有陽光照耀，種子自然就會在土裡腐爛;即使能長出芽來，也是非常脆弱的。小孩子的煩惱種子(貪、嗔、痴、慢、疑等)和罌粟花的種子一樣，影響力還很小，關鍵在於不要讓它繼續成長。父母如果認同他的負面情緒，或者沉默以對，都將是一種鼓勵，那麼負面情緒就會慢慢擴張。如果生在佛教家庭，從小就被教導說傷害別人、將別人的物品佔為己有、惡口傷人、動手打人等都是非常不好的作為，慢慢地，小孩子就懂得去改變自己，因為是非觀念已經播種在他的心靈上。現在有很多家庭是溺愛勝過於教育，而讓小朋友失去是非觀念。
不僅如此，大人更是普遍溺愛自己。我們都明白包括十不善等負面情緒和行為是不好的，因為沒有人喜歡被傷害，沒有人願意被砍殺。別說用兇器傷害，就連言語上的辱罵、諷刺、誹謗，都會讓人覺得非常不舒服，就像用針扎心一樣痛。但是，當我們對別人做這些事情時卻總有一大堆理由，會對自己說：「這樣做雖然不好，我也不想這樣，但我是逼不得已的。」
人心本質的佛性是清凈的，但被客塵污染而產生無明的時候，已經有魔性和佛性並存於心中。在佛性的這邊，人當然希望自己被別人認同，被別人關愛，所有人都用溫和愛語對自己說話;但反過來看，自己對別人能不能這樣付出呢?非常困難。短時間的付出或許可以，長時間是很不容易的。
殺生也是因為煩惱而產生的。人們會因為貪念而殺生，其中最嚴重的就是為了滿足食慾的貪念而殺生。很多人看到動物時就會因為想吃它的肉而殺害它。此外，有人只是為了玩弄動物而殺生。很多人去釣魚、打獵，只是當成娛樂喜好而已。
人們有能力卻不反省，就會因為無知而變得盲目且盲從，根本不清楚所作所為是應不應該，很多時候自認為的「應該」，其實是煩惱在作祟。有多少狂妄自大的人到處發動戰爭，最後被傷害的都是無辜的平民百姓。又或是看上了別國的石油、財富、土地，於是就找一個理由發動戰爭，這種情形也很多。
殺生的原因中，最嚴重的不是嗔恨，而是傲慢。因為我方有能力，如果對方不認同我方的想法，就強迫對方認同，而能力就是武器、權力、金錢。而且傲慢還帶有貪念。譬如長相很好看的人會藐視長相不如自己的人，這叫做色慢。我們可以發現，長得英俊的男人或漂亮的女人，大多數傲慢心會比別人強。
