修持蓮師心咒有三種方法。第一種是以祈禱的方式修持，下等修行人即初學者只能以這種方式。祈禱的方式就是你的意念到了，蓮花生大士就到了。
當你憶念蓮花生大士在你的前上方，正以慈悲之心垂視著自己，如果你的意念堅定不移，蓮花生大士真的就在你的前上方。主要是我們自己的心念，心念到哪裡佛就到哪裡——你的心念到了前上方，蓮花生大士就到了那個地方；你的心念到了自己的心裡，蓮花生大士也就在你的心裡。
以祈禱的方式修就像剛才講的那樣，剛開始時電話號碼不能弄錯，祈禱蓮花生大士就是念「嗡啊吽 班匝格熱巴瑪色德吽」，用它跟蓮花生大士溝通。蓮花生大士知道了你的祈禱就給你加持，給你能量，並以此啟發你自己內在的能量，這就是與蓮師感應道交的方式。與佛感應道交是一種極大的享受，如果真能感應道交，不要說一兩個小時，就是七天七夜，也不會感覺時間漫長。
通過自己虔誠心的祈禱引發佛菩薩的能量，這個能量反過來又啟發了自身的能量，這是一種能量場的交換，威力超乎想像。滿滿的能量在你的血液里流動，你肯定會法喜充滿。這時若去打飯，齋堂的人就能感受得到；若跟同修打招呼，同修也能感受得到你這種與平時不同的特別魅力。我們就要這樣修持。
我們現在沒有與佛感應道交，內在根本沒有什麼能量場，更不可能洋溢於外。我們感應道交的都是自己過去的事、山下的事，諸如家裡的那位菩薩，單位的領導等，這樣就不好了。
以祈禱的方式修持，一祈禱蓮花生大士就會發光，這個光代表蓮師的能量場與加持。通過這個能量場消除了自己的業障，自身的能量場也隨之現前了。
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