許多經，都說持咒，可以治癒各種疾病，甚至連一切貪嗔痴心病，亦能去除。持咒方便，易於習誦。口誦即是真行，能斷煩惱，安樂法身，不需要通教典，即可成就。如病人得了葯，服之能除病安身，不需要精通醫書。如果要先廣知醫書，精通葯性後，再去治病，這種人，恐怕是萬中人難找一個。許多修行法門，都要求明悟真心，然後修行。對條件不具備的眾生來說，是比較難的，故佛設此真言門以利廣大眾生。持咒，可以越過「依教生信，依信生解，依解起行」的路子，如同服藥治病一樣，不解葯性，並不影響治療，唯信葯可治病就行了。
念咒有什麼用?
釋迦牟尼說：「咒力不可思議，」豈虛誑哉。但是，念咒卻不能僅強調其「咒力」的神秘性，若一味的將之神秘化，那便跟「喃巫」沒有分別;而且層次跟許多原始宗教無異。
每一個聲音，其實是一組聲波頻率的振動。每個人發音，振動的幅度有高低大小的差別，但同一聲音，其振動頻率卻無分別。所以你擘盡喉嚨念一聲「鴉」，而我低聲在喉嚨念一聲「鴉」，兩個「鴉」，每秒鐘的振動次數都應該相同，只是你發出的聲波波幅高，我則波幅低，如是而已。
某一頻率的物體，當受到同一頻率振動時，這物體便會發生振動。在我國古代已有「銅山東崩，洛鍾西應」的故事，那隻是因為銅山跟洛陽的銅鍾，有同一振動頻率而已。
是故念咒雲雲，在生理方面的作用，便是可以藉咒音來振動自己的內臟，以至神經系統、內分泌系統。
因為「脈」便是人體生理結構的代名。勤力念咒，愈念愈舒服，即是生理上的良好反應。因此，並不是每條咒都適合任何人，每個人都有對自己特別適應的咒，因為每個人的生理結構都不一樣，是故見咒就念，未必有益。
首先，是可以使我們容易集中意念。修密宗的第一步，是意念集中的訓練。佛家將人歸納為「身語意」三份，因為能夠有行為舉動者，不是身，便是語或意。想飲茶，拿起茶杯，呷一啖茶入口，「想飲」，是意的活動，拿起茶杯，是身的活動，呷一啖茶，便是氣的活動(氣即是「語」)。而念咒雲雲，則正是藉此調氣，亦是「語」方面的修持。氣能調，意念便容易集中。
任何人都一定有過這樣的經驗，當我們心猿意馬、雜念紛呈、六神無主的時候，便會感覺到氣喘，與此相反，則是「氣定神閑」。
「氣定神閑」這四個字，用得真好，蓋必神閑後才能氣定，一慌亂，氣便不能定矣。也可以反過來說，必須能氣定然後始能神閑，假如氣喘如牛，想「神閑」便十分困難。所以密宗念咒，是一邊念一邊調氣，調到氣順，意念便容易集中了。
是故念咒不必太快、不必太高聲，每個人都有自己適宜的音量與速度，各適其適，便會愈念愈順氣，斗大聲、斗快，自己亂自己的心意。
藏密修持的初步成就，是使氣能入中脈。氣能入中脈則得定，同時生起出世間的智慧。因此，念咒並不是「入定」，但能習慣念咒，則可以因氣調、脈順而容易入定。也可以說，念咒其實是訓練意志集中的前行過程。這部分作用，屬於心理。
