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葯師咒來自《葯師琉璃光如來本願功德經》。葯師琉璃光如來，是東方凈土凈琉璃世界的教主。葯師法注重利益現實人間，故特別契合當今時代的眾生。持葯師咒是易行的葯師法門，若能至心修持，不僅有消災（免除疾病、橫逆、貧困等之苦）延壽滿願的利益，還有促使眾生早成佛道的功德。即早課十小咒之一。
彼葯師琉璃光如來得菩提時。由本願力觀諸有情。遇眾病苦瘦瘧干消黃熱等病。或被厭魅蠱道所中。或復短命或時橫死。欲令是等病苦消除。所求願滿。時彼世尊入三摩地。
名曰：「滅除一切眾生苦惱」。既入定已。於肉髻中出大光明。光中演說大陀羅尼……
爾時光中說此咒已。大地震動。放大光明。一切眾生病苦皆除。受安隱樂。曼殊室利。若見男子女人有病苦者。應當一心為彼病人清凈澡漱或食或葯或無蟲水。咒一百八遍與彼服食。所有病苦悉皆消滅。若有所求指心念誦。皆得如意無病延年。命終之後生彼(葯師琉璃)世界。得不退轉。乃至菩提。是故曼殊室利。若有男子女人。於彼葯師琉璃光如來。至心殷重恭敬供養者。常持此咒。勿令廢忘！
─《葯師琉璃光七佛本願功德經卷下》。《大正藏》第十四冊頁414中─下。若有受持此真言，能拔身中過去生死一切重罪，不復經歷三塗，免離九橫，超越眾苦。─《葯師如來念誦儀軌》。《大正藏》第十九冊頁30中。
修行目的非常重要的定律——唯心凈土，萬法唯心造。若要國土凈，必先凈其國人心。地藏經說：“起心動念，無非是業，無非是罪。”你們看我們修行，很多蚊子過來騷擾，它們專咬那些人呢？不專心修行的人，為什麼？因為不專心修行，腦海裡面就妄想紛飛，心凈不下來，動來動去的，很燥熱，心火就起來了，汗也就不知不覺地流出來了，有了汗味當然蚊子就聞訊趕來，發動攻擊了。相反如果我們心地清凈，專注於修行，心靜自然涼，《葯師經》說到：“或有水火，刀毒懸險惡象，獅子、虎狼、熊羆、毒蛇、惡蠍、蜈蚣、蚰蜒、蚊虻等怖，若能至心憶念彼佛，恭敬供養，一切怖畏皆得解脫。”
我們修行要發利益眾生的大菩提心，不要滿足於利己的人天福報，做什麼大富長者、國王、大臣，要做大導師，像阿彌陀佛一樣，做眾生的接引導師，這個就像大學裡的碩士生導師、博士生導師一樣，帶領指導眾生學習葯師法門。我們修行發願往生東方，就是去那裡做葯師佛的學生，在那裡成就果位，得不退地菩薩位次，乃至成就無上正等正覺。
修葯師法門大家會得到葯師佛護佑，肯定一個受戒的人總比不受戒的人更上一層法意。放心持戒，多種善因，當來必受善果，而不必怕犯戒而不受戒！
