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我們再來看這一段經文的第二層意義，代眾生苦。若諸眾生，因其積集諸惡業故，所感一切極重苦果，我皆代受，令彼眾生悉得解脫，究竟成就無上菩提。
眾生自無始以來，由於貪嗔痴煩惱的驅動，造作惡業，惡業越積越多，到了業力成熟之時，就會感得極重的苦果。或墮入畜生道，或者墮入餓鬼道，或者墮入地獄，甚至是無間地獄，受無量苦。菩薩慈悲，悲憫眾生，不僅將自己所修功德迴向眾生，而且還發心代眾生受苦，令眾生因菩薩功德悉得解脫，究竟成就無上菩提之樂。
可能有人就會心生疑惑，佛法常說自作自受這是因果的必然，眾生造了惡業當然要受苦，而菩薩沒有造業，怎麼會代眾生苦呢?清涼國師從七個方面來解釋。
第一是起大悲心。菩薩見眾生造諸惡業，受種種苦，生大悲心，願處惡道，代眾生苦。比如《八大人覺經》中說「願代眾生受無量苦」，這是發大悲心代受。我們現在是處在凡夫地，在事上我們沒有能力來代，雖然在事上我們還做不到處惡道中來代眾生受苦，但是發起來這個大慈悲心，這樣能夠增上成佛的資糧，來伏斷我執。也就是現在我們雖然不能用神通變化，處惡道中去幫助眾生，但是只要我們有了這個心了，有了這個慈悲的心了，有了這個心量了，我們就能作為我們成佛的資糧，能夠伏斷我執。
第二是修苦行。菩薩為利益眾生，修種種的苦行，而且菩薩因為修行，得勝妙三業，能為眾生作增上緣。我們看，修苦行的這些比丘們、法師們，在路上按照佛的戒律，日中一食，三步一拜，去托缽去拜山。這樣能夠受化種種的眾生，叫他們知道佛法的高貴、真理的存在，以菩薩種種的苦行，這樣來代眾生苦。
第三、留微惑。菩薩已經成就自利，斷惑證真，菩薩已經成就功德，但是為了救度眾生，故意保留煩惱而不斷除，在六道中受生，為眾生說法，使他們不造業，自然也不受苦，所以稱為代受，這是留微惑。留微惑的目的，不是自己不能斷證，立刻就可以斷證了，但是他們要生慈悲心，為了度化眾生，他們要作夢中佛事。
第四、自捨命。菩薩能知有人必作無間罪業，將會受大苦果，如果沒有其他辦法、沒有其他的方便來阻止此人的惡行，只有斷其性命，才能讓他不造惡因，免受地獄之苦。在這種情況下，菩薩寧可自己來承擔殺業，受墮落惡道之苦，這稱為代受。
《報恩經》中說：「菩薩知恩報恩，修大方便，利益眾生，應識隨宜，顯示方便。」經中也講了一個公案，在過去無畏王如來滅後，正法之中，還是無畏王正法的時候，有一個婆羅門子，聰明機智，受持五戒。他因為有事情，同五百人結伴遠行，當走到險路的時候，有五百群賊、土匪要來劫持他們。這五百土匪中，有一個人與這個婆羅門子曾經是好友，他知道這五百人將要被害的人中有他的好友，他就偷偷的來告訴這個婆羅門子。他說夜裡會有群賊，我們這些土匪會來打劫你們，會要你們的性命，你們趕緊離開這里，別告訴你的同伴，你趕緊離開。婆羅門子心想，我要告訴了我的同伴，我的同伴肯定會害死這個土匪的，這樣就會造作殺業，他的這五百同伴就會墮落惡道;如果不說，他自己先走了，又怕這五百個土匪害死他的同伴，這些群賊、這五百土匪也是要受惡道苦報的。想到這里，婆羅門子就把他昔日的同伴這個土匪給殺了，他寧可自己受三惡道的果報，然後他就告訴了他的同伴們。他的同伴們就問他，你為什麼要殺人?為什麼要作惡?婆羅門子就把這個事情的來龍去脈，告訴了他的同伴們，他的同伴們聽了以後，知道他能為了發起菩提心，不讓他們墮落，非常的受感動，都發起了菩提心。這些土匪們知道了這個事情以後，也都發起了菩提心，這個就是自捨命。
第五是由於初願。菩薩從初發心時，就願為眾生受苦，所以到願力成熟時，常處於惡道救拔受苦眾生。比如地藏菩薩發願，他在無量劫前就發願，地獄不空誓不成佛，一直到現在，他所度化的眾生，成佛的，已經不可思不可量不可說。經中看，文殊菩薩以神通智慧力都說不能盡，他所度化的眾生成佛。而地藏菩薩還在堅守著初願，地獄不空誓不成佛。
又比如世尊在因地行菩薩道時，受生為一條大魚，這個魚身長一里多。海邊有一個國家，遇到乾旱之年顆粒不收，人們飢餓難忍，互相殘食，人吃人。大魚見了非常的難過，他就想用自己的身體，來消除眾生的飢餓之苦，於是大魚就游到岸邊，擱淺在沙灘上。大家見了，就成群結伙的來割他的肉充飢，大魚身上的肉割了又長，長了又割，幾個月下來，這個大魚還是活著，魚肉還在不停的長來供給人們。天神見了於心不忍，他來到大魚跟前說，幾個月來，你忍受著割肉的痛苦，怎麼受得了呢，為什麼不早些結束痛苦，來結束自己的生命呢?來擺脫割肉的劇苦呢?大魚說，我如果死了，人們還是要互相吞吃的，我不忍心看到人吃人的慘劇。天神聽了非常的感動，讚歎說，菩薩的大慈大悲之心是別人難以企及的，你以後必定成佛來度化我等苦惱眾生。又比如，佛放光加被令眾生離苦，這些都屬於由於初願，代眾生苦。
第六是同一真如性。菩薩的大願和眾生所受的苦報，都是同一真如本性。菩薩以具真如本性，而生起的這個大願，潛入到真如性具的苦報當中悲心救苦，稱為代受。就是說，菩薩和一切眾生的真如本性都是同一的，都是平等的，所以代眾生受苦。
第七是法界身。菩薩證得實相理體，以法界為身，與一切的眾生自他無二，眾生受苦即是菩薩受苦，所以稱為代眾生苦。
以上我們講的菩薩代眾生苦的七種，第一種是起大悲，這個只是意樂，也就是菩薩發心代眾生苦;第二種修苦行和第三種留微惑是代眾生苦的助緣;自捨命代眾生苦，還有由於初願、初發心的時候就願代眾生苦，這個是真實代受;最後兩種同一真性，和平等法界身是稱合法界理體的觀照。由上論述可知，菩薩是決定可以代眾生苦的。
那講到這里，可能就有人又要問了，既然菩薩能代眾生苦，為什麼還有這么多的眾生在受苦呢?
清涼大師說：「然約，有緣方能代爾。」意思是說，你要與菩薩有緣，也就是說有緣的眾生，菩薩才能代其受苦。在《華嚴疏鈔》中還有另外兩種含義：第一是業有定業和不定業，就是不定業可以代，定業不可以代受;第二種如果受苦時，對眾生有益，菩薩就會讓眾生受一些有益的苦，這樣才能讓他真正的離苦得樂。
就像我們父母教育孩子，孩子犯了錯以後，必須要施以一定的懲罰的，讓他知道會有什麼惡果，這樣他也就不會再犯錯了。再比如父母疼愛孩子，但是父母為了孩子的茁壯健康成長，也會把孩子教給一些嚴厲的老師來管教，老師的嚴厲，這樣能幫助孩子將來可以健康成長。由此可知，雖然菩薩願以平等心代一切眾生受苦，但是因為由於眾生無緣，或者為了眾生能吃一些有益的苦，也就是說，能吃苦而能受益，所以現實世界仍有無量的受苦眾生。
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