五大明王，又作五大尊、五忿怒、五部忿怒，即不動明王、降三世明王、軍荼利明王、大威德明王與金剛夜叉明王。
由於佛乘密法的全息哲學科理趣乃是理、智真如之具象表達，胎藏界喻理曼陀羅即理法界，錶行者之身心與清凈法界之毗盧遮那如來同等無二，全息意義即虛實宇宙之本然秩序和規律，故曰「理」也；金剛界喻智曼陀羅即智法界，錶行者成就佛身，身心體認虛實宇宙本然規律和秩序之過程，故曰「智」也。
金胎不二，故在理曼陀羅和智曼陀羅僅僅是表象有別，真如理趣無二。成就無上正等菩提即是成就三世無障礙智亦即法界體性智。法界體性智涵括大圓鏡智、平等性智、妙觀察智和成所作智。
五智由九識漸次緣慈悲喜舍六度萬行持戒護律轉化而來。九識即眼識、耳識、鼻識、舌識、身識、意識、阿陀那識、阿賴耶識、菴摩羅識。
《解深密經——心意識相品第三》雲「爾時廣慧菩薩摩訶薩白佛言：世尊，如世尊說，於心意識秘密善巧。菩薩於心意識秘密善巧，菩薩者齊何名為於心意識秘密善巧？菩薩如來齊何施設，彼為於心意識秘密善巧？菩薩說是語已。爾時世尊告廣慧菩薩摩訶薩曰：善哉善哉，廣慧……汝應諦聽,吾當為汝說心意識秘密之義。廣慧當知，於六趣生死，彼彼有情墮彼彼有情眾中。或在卵生，或在胎生，或在濕生，或在化生身分生起。於中最初一切種子，心識成熟展轉和合增長廣大。依二執受，一者有色諸根及所依執受，二者相名分別言說戲論習氣執受。有色界中具二執受，無色界中不具二種。廣慧，此識亦名阿陀那識，何以故？由此識於身隨逐執持故。亦名阿賴耶識，何以故？由此識於身攝受藏隱同安危義故。亦名為心，何以故？由此識色聲香味觸等積集滋長故。廣慧，阿陀那識為依止，為建立故。六識身轉，謂眼識耳鼻舌身意識。此中有識，眼及色為緣生眼識，與眼識俱隨行，同時同境有分別意識轉。有識，耳鼻舌身及聲香味觸為緣，生耳鼻舌身識，與耳鼻舌身識俱隨行，同時同境有分別意識轉。廣慧，若於爾時一眼識轉，即於此時唯有一分別意識，與眼識同所行轉。若於爾時二三四五諸識身轉，即於此時唯有一分別意識，與五識身同所行轉。廣慧，譬如大瀑水流，若有一浪生緣現前唯一浪轉，若二若多浪，生緣現前有多浪轉，然此瀑水自類恆流無斷無盡。又如善凈鏡面，若有一影生緣現前唯一影起，若二若多影，生緣現前有多影起，非此鏡面轉變為影，亦無受用滅盡可得。如是廣慧，由似瀑流阿陀那識，為依止為建立故。若於爾時有一眼識生緣現前，即於此時一眼識轉。若於爾時乃至有五識身生緣現前，即於此時五識身轉。廣慧，如是菩薩雖由法住智，為依止為建立故，於心意識秘密善巧。然諸如來不齊於此施設彼，為於心意識一切秘密善巧菩薩。廣慧，若諸菩薩於內各別，如實不見阿陀那，不見阿陀那識，不見阿賴耶，不見阿賴耶識，不見積集不見心，不見眼色及眼識，不見耳聲及耳識，不見鼻香及鼻識，不見舌味及舌識，不見身觸及身識，不見意法及意識，是名勝義善巧菩薩。」
全息體解此段經文，九識的前五識眼耳鼻捨身識關乎「色——物質」之表象，第六「意識」則介乎「色、空——物質精神」之間的深層轉化關係，其第七「阿陀那識」、第八「阿賴耶識」和第九「菴摩羅識——心識」則為純粹的「空識——精神」，亦即「空」之實相。第九識涵括前八識，其排列並非直線而是圓環，一一識涵括其餘八識，故而方有「轉識成智」之可能，前五識轉化為成所作智，第六識轉化為妙觀察智，第七識轉化為平等性智，第八識轉化為大圓鏡智，第九識轉化為法界體性智，故四智、五智便因六度萬行而成就。如果比較形象地比喻九識正如「如環無端」的圓環光譜。
此五大尊乃九識所對應之「染」智，五佛則九識所對應之「凈」智。故五大明王，對應於金胎兩部曼陀羅之表象尊位，乃五佛為降伏內外魔障所變現之教令輪身。
中央不動明王為大日如來之教令輪身(金胎兩部相同)，可降伏一切諸魔即一切鬼魅惑亂，消除令九識不能轉為凈智的一切障礙。
東方降三世明王為金剛界阿閦如來、胎藏界寶幢如來之教令輪身，可降伏大自在天或天魔即侵害正法之大自在天魔眾，消除令阿賴耶識不能轉為凈智的障礙。
南方軍荼利明王為金剛界寶生如來、胎藏界開敷花王如來之教令輪身，可降伏五陰魔或行疾疫惱害人之一切阿修羅眾諸鬼神，消除令阿陀那識不能轉為凈智的障礙。
西方大威德明王為無量壽如來之教令輪身(金胎兩部相同)，可降伏人魔或興惡風雨害有情之一切毒龍，消除令意識不能轉為凈智的障礙。
北方金剛夜叉明王為金剛界不空成就如來、胎藏界天鼓雷音如來之教令輪身，可降伏地魔或降伏奪人精氣之一切葯叉，消除令五識不能轉為凈智的障礙。
障礙消除，即是「合氣」，「合氣」則得身心清凈，由「染」智將九識轉化為凈智，行者凡夫肉胎之身即成金剛不壞之體。亦即先「凈」色身——物質之身，漸漸「凈」空身——精神之體，即身成佛義理明也。
不動明王表第九識菴摩羅識之「染」智；降三世明王表第八識阿賴耶識之「染」智；軍荼利明王表第七識阿陀那識之「染」智；大威德明王表第六識意識之「染」智；金剛夜叉表表前五識眼耳鼻捨身識之「染」智。
《新譯仁王經奉持品雲》「佛於未來世受持三寶之處，使五方菩薩護其國。」可參閱「唐密的護國利民思想及其現實意義http://www.tmfy.net.cn/show.aspx?id=487&cid=37」
五大明王所對應之正*輪身菩薩依次為般若菩薩、金剛薩埵、金剛寶菩薩、金剛法菩薩、金剛羯磨菩薩。
自性輪身，為佛住於自性之法身，故雲自性輪；正*輪身為住於菩薩以正法度人之真實身，故雲正*輪；教令輪身為受佛之教令，化現忿怒形，摧伏頑劣眾生之身，故雲教令輪身。然無論金胎兩部理智之別，一切聖眾悉皆清凈法身之等流化顯，故在九會曼荼羅，為大日之自性輪身，於理趣會現金剛薩埵之正*輪身，又於降三世會，現降三世明王之教令輪身。
《八大童子秘要法》雲「金剛手曰：一切意相不同，或為順，或為逆。是故如來現慈悲之身，隨而作利益。解曰：諸佛之大悲，為愍眾生故。即於順者以順應之，若於逆者則以逆制之。一佛住於忿怒三昧時，十方諸佛同入於忿怒三昧。毗廬遮那於無相中示現明王時，諸佛菩薩不更現忿怒之身乎？故四方之如來現教令之身，降伏眾魔也。然本誓各有不同，且常不隨逐於行者。或降三世菩薩降伏天魔或三世之貪嗔痴，或軍荼利降伏毗那耶迦之常隨魔及人魔，或焰摩德迦降伏龍魔及諸怨敵，或金剛夜叉調伏眾魔及無智者。不動明王，恆隨行者，若天、若毗那夜迦、若鬼等所作之障礙，一時消滅。」
