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窺基是唐朝一代法師玄奘的高足弟子。窺基之於玄奘，猶如子夏之於孔子。孔子學說須有子夏輩西河傳經，方可闡揚宏發，廣被於世；而玄奘之學，窺基不僅有克紹箕裘力，且具後修轉密的功績。
玄奘從印度取經回來後，天天在長安慈恩寺里埋頭譯述，發誓要把蘊含至大至深智慧的佛法傳遍中土。然而有一件事情始終讓他牽掛，寺里的經籍箱堆篋疊，而人的肉身終歸毀壞。唯有薪火相續，找到聰慧的後生，才能使弘揚佛法的事業不至一旦而廢。可是，廟堂之上，庸器居多，難以為任。所以，他時常漫步長安街頭，慧眼炯炯。
一天，他在鬧市之間，看見一位魁梧少年。眉清目秀，安詳而行。驀然間若覺似曾相見。前緣有識，又回想起在印度計劃回眼程時，曾在尼犍子佔得一卦，說他東歸必得哲嗣。便連忙打聽這少年家世。原來是當朝開國公尉遲宗的公子。玄奘感嘆道：「如此靈慧的孩子生在將門，不可思議！也是有緣，我的衣缽可以傳下去了！」即刻前往國公府拜訪。尉遲宗想知法師來意，雖然不忍骨肉分離，但想到一代高僧如此器重，也頗為得意。那時代，佛教不僅是清廟凈僧的空寂之事，還是一種普遍的信仰，鮮活的事業。所以雖貴為國公，一見大法師鍾器兒子，怎會不高興呢？便答應了玄奘的要求，還說：「小兒是有些不同，他母親見月輪入腹，就懷上他。從小就不愛耍槍弄棒，一讀書就精神抖擻哩！只怕這孩子脾性倔強，難以教化。」玄奘雙手合什，道：「窺基資質聰穎，終成大器。非您老生不出來，非小僧莫能賞識。」說罷拉起徒弟飄然而去。這年窺基年方十七。
窺基由貴族公子削髮為僧，在當時非常轟動。長安一帶的人都稱他為「三車和尚」。相傳他開始死活不肯出家，除非玄奘答應他三件事。即不戒女色，不戒葷腥，不戒美食。不料玄奘欣然應允，用三輛馬車滿載歌妓美食這些窺基享受慣了的東西，帶著窺基回寺。據說玄奘想先把窺基領進佛門。然後再灌注佛家智慧，使之漸漸破除慾障。後來窺基被弟子們問及此事，淡淡一笑，說：「我九歲時就失去母親，逐漸疏遠世俗。再說，慈恩寺里恐怕也無處安放這三車東西吧？」於是弟子斂心，決意摒棄道聽途說的虛妄。
窺基果然不負玄奘的期望，博聞強記，思辨銳利，人人嘆服。過了幾年，他奉詔跟從玄奘翻譯佛典。玄奘一邊譯，窺基一邊記，師徒倆相互析難解疑，在清寂的佛堂里度過了許多虔誠的日子。
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一天清晨，長安城中另一座名剎，西明寺的大鍾轟鳴，測法師要升座說法。鍾聲也驚動了師徒倆，聽說測法師要講解《唯識論》，不禁相視而笑，因為他們剛疏通這部珍貴的經典。待他們趕到西明寺道場，卻發現測法師在蓮花座上娓娓而談，釋義圓融，聽眾無不交口稱讚。窺基十分羞愧，沾沾自喜之心頓時灰飛煙滅：「竟有人無師自通。其悟境實在高我一頭。」當然他並不知道測法師曾經向慈恩寺譯場的看門人行賄，每天溜進去，躲在角落裡偷聽他們師徒的討論。玄奘安慰他說：「測法師還未懂因明之學，沒到至境。」於是傳授陳那的學說，窺基因此精通因明，辨理縱橫。然而窺基還是若有所失，玄奘知道他正在澄明圓覺的門檻外徘徊，便說:「雲遊去吧。」
欲以雲遊破窺基證道之感，這正是玄奘法師的高明處。就實質說，佛教不是一種學理，而是一種證驗，不論大乘小乘講的修悟，經書案卷，不過渡水舟筏，捕兔筌蹄而已。唯識之理也不是小乘家的自了之學，它追取的濟世化生，澄明圓覺，必有兩方面的感悟，方可臻至。且看窺基之游如何?
登太行，過五台，窺基一日來到西河，在一座古廟里投宿。夜裡夢見自己恍惚在半山裡，四處昏暗，隱隱約約聽見山崖下有無數人痛苦地呼喊，凄楚摧心。窺基不忍心聽見這種悲慘的聲音，就急著往上攀登。來到山頂，發現山峰竟然象琉璃一般晶瑩光潔，放眼遠望，眾多國度猶似微塵歷歷可見。突然有一個聲音從頭頂上飄下來：「停步，窺基不該到這裡。」窺基一抬頭，望見一座光華眩目的城市。過了一會兒，兩位仙童走出城來問：「你看見山下那些備受世俗之苦煎熬的生靈了嗎？」窺基照實回答：「雖聽到喊聲凄厲，卻看不見確切的形狀。」仙童便擲下一柄劍，說：「剖開你的肚子就可以看見了。」「剖開肚子，性命焉存？玄奘師傅的衣缽還賴我以傳呢。」「執著幻相，居然還要傳法，三車和尚的說法倒有些道理呢。」窺基又惱又驚，一下子把劍插入腹部。這時只見兩道白光如長虹一般從腹中躍出，照映山下，窺基於是看見了無數人沉淪在深淵里，飽受酷刑，在絕望地掙扎著。這時，仙童又扔下兩軸紙和一管筆，轉身進城。窺基接住，仰頭一看，城市也無影無蹤了。天亮醒來，窺基驚魂未定。
到了夜裡，寺里發出萬丈光芒，經久不散，窺基循光而去，發現是兩軸書在發光，展開一看，竟然是《彌勒上生經》，回想前一夜的夢境，窺基恍然徹悟：原來是佛祖感化我，讓我疏通佛理，以大慈悲之心去救濟苦難眾生啊。想當初發願把佛理融匯一貫，擔心參雜譯經會失去佛法的精華，只得到佛法的皮相，正好比夜裡夢見莊嚴法相，早晨起來卻去尋找自馬。我何等糊塗，注經是為濟世，不為逞才！而我卻是去找白馬啊。
窺基這么一悟，從此在佛法上勇猛精進。回到慈恩寺後，更加勤奮著述，疏通大小乘教典籍上百種，人稱「百本疏主。」
永淳元年(公元682每)的一天，窺基象往常一樣趺跏入定，他的朋友宣律師知道他在神遇佛教天王的使者，但這次時間很長，宣律師感到奇怪，窺基說：「剛才大乘菩薩來了，侍從極多，我的神通被壓制了。」過了不久，窺基就逝世了。他的墳塋緊靠著玄奘的骨塔。弟子們悲痛不已，都懷念這位心地仁慈，誨人不倦的大師。
