民國四十二年的舊歷除夕，在各方行化的內院學僧，回到內院過年，慈航對弟子們說:［我的舊舍（指色身）已壞，要換新舍，我明年二、三月不走，最遲三、四月就要走。］他並囑咐各人，不要把消息傳出去。果然到翌年舊歷四月初四——即四十三年（一九五四）五月六日示寂。
慈航法師園寂後坐缸，面目如生，儼然老僧入定，封缸後，安葬在後山墓塔。五年之後，在四十八年五月十九日，弟子們開缸檢視，發現他肉身不壞，袈裟完好，面呈紫色，眼睛發亮，耳鼻囗俱全，唇尚軟，並長出稀疏的頭發和髭須，眉毛亦長了許多。後來經裝金後，迎歸於彌勒內院安座供養——成為台灣第一尊肉身菩薩。
慈航法師簡介：慈航法師(1893--1954)，福建省建寧縣人，俗姓艾，號繼榮，字彥才。父親炳元公，監生出身，設塾授徒為業。母親謝太夫人，以淑德聞於鄉里。慈航法師幼年隨父讀書，不幸10歲那年，母親謝氏病故。過了2年，父親炳元公亦謝世。他有一弟早夭，至此他孑然煢獨，為外祖母接回家中，依舅氏以活。他的舅父業裁縫，專門為出家人縫製僧衣。以這種因緣，10多歲的慈航法師也就隨著舅父學裁縫手藝，並且經常到各寺院送衣服。他到寺院，每聞鍾聲梵唄之聲，心生歡喜；時與寺中僧侶接談，亦甚契機，由此結下佛緣，日久之後，萌生出家修道之心。
由於輟學多年，慈航很難讀懂深奧的經書，於是轉往寧波、蘇州、常州、蕪湖、南京各寺院，並巡禮天台、普陀、九華等佛教名山。期間，曾聽教於諦閑大師，學凈於度厄長老，參禪於圓瑛大師，淬厲奮發，精勤修學。後來，他受太虛大師新佛教革命運動思想的影響，逐漸萌發革新佛教的意念。
慈航法師17歲於泰寧縣峨眉峰慶雲寺(峨眉庵)禮自忠和尚剃度出家。後就讀於閩南佛學院，追隨太虛大師；於安徽、廣東、上海、江蘇、江西、湖北等地巡迴演講弘法，推動太虛大師“人生佛教”的改革理念；為中國佛教國際訪問團成員之一，隨太虛大師訪南洋，宣傳抗日國策；曾於緬甸駐錫4年並於仰光創設“中國佛學會”；亦曾駐錫於馬來西亞、新加坡7年之久，並於檳城接受圓瑛大師傳付曹洞宗法脈；在新加坡與馬來西亞期間，創設“星州菩提學院”“檳城菩提學院”“星州菩提學校”“檳城菩提學校”“星州佛學會”“雪州佛學會”“怡保佛學會”“檳城佛學會”“人間月刊”；後期駐錫於台灣，主持“台灣佛學院”“靈泉佛學院”“獅山佛學院”，收留大陸到台青年僧人。1949年，受誣告以“匪諜罪”被台灣有關方面逮捕入獄，幸得孫立人將軍夫人張清楊居士、李子寬先生及斌宗法師等營救，經半月，始得釋放。晚年，駐錫台灣彌勒內院，舉辦僧伽教育，進行環島弘法。使彌勒內院在台灣佛教界一枝獨秀。1954年，示寂於台灣彌勒內院，肉身不壞，成就台灣首尊全身金剛舍利，人稱“慈航菩薩”。有一百二十萬言《慈航全集》遺世。
慈航法師一生，身棲大陸、南洋、台灣。學承太虛大師，法接圓瑛大師。三度閉關。推動與實踐“人生佛教”理念。主張以發揚文化、舉辦教育、推動慈善為佛教的三大救生圈。專於唯識學，修持彌勒法門。為致力台灣佛教僧伽青年教育的先驅。乃台灣首尊肉身舍利。其追隨者 以及辦教理念在其後的數十年對推動台灣佛教事業的壯大和提升，貢獻巨大，影響波及南洋及美國，直至今日。
